本研究利用時間序列分析登革熱的實際病例，找出登革熱的傳播模型、時間上的特性及限制因素；再利用交叉相關分析，計算登革熱病媒蚊指數與病例的關係及各區相關性。2002年高雄市登革熱病例暴增，因此本研究以1998年至2001年及2003年至2006年臺南市和高雄市的登革熱病例進行時間分段分析，利用時間序列自我迴歸（AR）模型分析2002年登革熱大流行前後傳染病行為的變化；本研究發現2002年以後登革熱傳播的模型正向強度有增加趨勢，而模型負向衰退的強度並沒有明顯改變，顯示登革熱在臺南市和高雄市的傳播情況越來越嚴重，然而傳染病的控管並未有明顯進步。此外，依照南區與高屏區登革熱病例數計算區域相關性，結果呈現不相關。而相鄰的臺南市與臺南縣，高雄市與高雄縣呈現正相關，顯示登革熱傳播應具有較強的區域性。在病媒蚊指數與登革熱病例相關性研究中，臺南市存在正相關。當臺南市病媒蚊指數增加，登革熱的可能病例數於四至五個月內跟著增加；此結果與新加坡研究有異。Joseph R Egger等研究1966-2002新加坡的登革熱資料，用2個數學模型研究傳播的強度、發生率和病媒蚊的繁殖。發現病媒蚊指數明顯下降，但是登革熱病例卻不斷的增加；這是未來值得探討的研究主題。
