肝癌疫苗的表位預測

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Title:	肝癌疫苗的表位預測 Epitope Prediction For Liver Cancer Vaccines
Authors:	莊玉如
Contributors:	生物資訊學系碩士班
Date:	2008
Issue Date:	2009-10-12 10:35:29 (UTC+0)
Publisher:	亞洲大學
Abstract:	肝癌是亞洲國家常見的癌症之一。當醫師診斷出病人罹患肝癌時，經常都已經是肝癌晚期，導致肝癌的治療無法真正的治癒。肝癌的治療方法有很多種，手術治療、化學療法和放射療法等，但這些方法都有各自的限制性，無法真正的消除腫瘤細胞，因此希望研發疫苗來改善肝癌無法治癒的情況。癌症疫苗中若存在著有效的细胞毒性T 淋巴细胞（CTL）表位（epitope），那在免疫系統中這些CTL表位將可以阻止腫瘤的成長。因此我們嘗試在CT 抗原中尋找肝癌疫苗可能的有效表位。參考肝癌文獻，進行十六個CT 抗原表位預測。肝癌疫苗中的有效表位可以誘發人體形成CTL 消滅腫瘤。利用兩個線上表位預測工具NetCTL 與MAPPP 伺服器進行預測，兩個伺服器共同得到的相同最佳表位是有效表位。文獻中十六個表達在肝癌的CT 抗原，包括SSX1、SSX2、SSX4、SSX5、NY-ESO-1 、SCP-1 、HCA587 、XAGE-1b 、OY-TES-1 、CAGE 、HCA661 、FATE/BJ-HCC-2、TPTE/BJ-HCC-5、KM-HN-1、ZNF165 和TSPY，得到四個最佳表位RLQGIFPKI、YLMPGFIHL、SLTEANEEL 和LLDDIMAEV，它們是肝癌多價疫苗的最佳候選目標，表位的位置在NetCTL 和MAPPP 伺服器是一致，而這些表位來自SSX5、CAGE、HCA661 和TSPY 蛋白，在肝癌均有高度的表達。表位預測的資料可以提供相關資訊給未來的肝癌疫苗研究者，減少表位實驗研究的盲目性。
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