基因轉殖作物外來基因Blast資?庫之建?

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Title:	基因轉殖作物外來基因Blast資?庫之建? The establishment of Blast database for foreign genes in transgenic plants
Authors:	施仁國
Contributors:	生物資訊學系碩士在職專班
Date:	2007
Issue Date:	2009-10-12 10:35:09 (UTC+0)
Publisher:	亞洲大學
Abstract:	全球基因轉殖作物的開發正蓬勃發展，支持與反對基因轉殖的論述彼此爭論不休，可辨認基因轉殖與非基因轉殖生物的方法，讓大眾能有選擇的權利是非常需要的。本論文的主要研究目的，在建立能偵測基因轉殖作物外來基因(foreign gene)的Blast 資料庫，提供快速的序列同源性比對，逐步分析與建立GMO 外來基因資料庫，為建立基因轉殖作物檢測系統的一部分。以基因轉殖作物外來基因(foreign gene)為研究對象，利用AGBIOS之GM Database 取得已通過評估可釋放於環境之GM 作物外來基因等資訊，並以BioPerl 設計操作指令群對NCBI Genbank 送出字串查詢核酸序列，自動取得相關的核酸序列建立本機Blast 資料庫，並使用免費且穩定的B2D Linux Server 平台，圖形化的WWWBlast 介面以提高操作便利性，建置一單機GMO Blast Database 系統平台，提供快速且有效率的比對。本系統平台提供建立特定基因之Blast Database 模式，查詢速度快、可單機或於區域網路(Intranet)內使用、自建資料庫擴充性高、更新序列快且方便，較其他單機免費的Blast 軟體更能符合實際需求。
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