探?乳癌細胞週期之調控因子訊號

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Title:	探?乳癌細胞週期之調控因子訊號 A study of cell cycle regulatory signal for breast cancer
Authors:	林榮鑾
Contributors:	生物資訊學系碩士在職專班
Date:	2007
Issue Date:	2009-10-12 10:35:08 (UTC+0)
Publisher:	亞洲大學
Abstract:	癌症成因可歸咎於細胞不斷的增生，因此研究癌症與細胞週期基因的調控機制，是探討癌症發生的重要工作。基因表達(Gene Expression)資料庫大量建置，使得我們可以運用電腦運算的方式來探索基因的調控機制。基於有相同基因表達行為的基因群，其功能也會有相似之構想，本論文嘗試透過生物資訊的方法，去尋找調控 cell cycle 之共同訊號。根據Michael Whitfield, and Sherlock, (2002)等人的論文，分別對乳癌五群週期性表達基因的 promoter 與轉錄因子結合位置（TF-binding sites），作序列比對。根據比對結果發現R11007;G002664 (Q9NS56)及R11006;G002663 (Q9NS56)這兩個轉錄因子結合部位同時出現於五個group中；在個別的組別中KNSL6、PRIM1、MCM6、FANCA及FLJ20510等五個基因的 promoter 有三個以上的調控因子結合位置。這結果顯示轉錄因子結合部位有組合性的可能，另一方面藉由蛋白質資料庫的資訊，可以找出轉錄因子結合部位對應之調控因子蛋白，然後再從這些調控因子蛋白找出相互作用的蛋白質，這些相互作用的蛋白質可能扮演調控TF的角色。最後此研究也發現乳癌基因中有高比率的基因是位於CpG islands 的1000 bp 之內(58/83，約70%)，顯示了乳癌基因與 CpG islands 的高度關連。
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