禽流感病毒抑制劑之虛擬藥物篩選

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Title:	禽流感病毒抑制劑之虛擬藥物篩選 Identification of potent small molecule inhibitor of avian influenza A (H5N1) virus
Authors:	陳勇瑞
Contributors:	生物資訊學系碩士班
Date:	2006
Issue Date:	2009-10-12 10:34:58 (UTC+0)
Publisher:	亞洲大學
Abstract:	過去這幾年流行性感冒在世界許多地區爆發大規模的疫情。所謂的禽流感(Avian influenza, AI)是由A型流行性感冒病毒所引起的疾病，致死率較一般流行性感冒為高。流感病毒依據病毒表面醣蛋白可區分為16種HA以及9種NA亞型。回顧過去，高病原性家禽流行性感冒(HPAI)的爆發多是源自低病原性H5或H7病毒突變而產生的。因為病毒每年皆會不斷突變，倘若禽流感病毒與其他人類流感病毒混合突變，進而演變為人傳人(Person-to-Person Transmission of Avian Influenza A)的新型流感病毒，將恐爆發大規模流行而導致數百萬人死亡。流感病毒的表面醣蛋白Hemagglutinin (HA)和人類唾液酸(sialic acid) 的結合是病毒入侵人體的啟始步驟。因此，為了能了解流感病毒的致病力，我們分析病毒的HA蛋白結構。唾液酸sialic acid是人類呼吸道上體外面非常重要的抗原。HA蛋白和sialic acid結合的親合力影響病毒是否能入侵我們的上呼吸道。因此，HA蛋白受體接合位置的演化突變，可能導致HA蛋白對sialic acid親合活性的改變，而爆發大規模禽流感疫情。為了瞭解禽流感HA蛋白過去演化的軌跡以預測未來可能的突變，我們從Swiss-Prot蛋白資料庫選取了82條禽流感H5N1 HA胺基酸序列進行演化速率分歧及特異性位置的分析，分析結果顯示，在1996-2005演化過程，我們找到2個specificity-determining positions (SDPs)；在不同國家病毒株間的演化，則有3個分數較高的SDPs。由HA蛋白上這些活性作用位置，我們希望能尋找可以做為可能的流感藥物的先導化合物(lead compound)。我們利用利用分子對接程式GOLD對Maybridge分子資料庫進行虛擬篩選(virtual screening)。實驗結果從Maybridge資料庫中的59284個化合物中篩選出2個有可能成為禽流感病毒先導藥物的化合物。其中的(diaminoBLAHyl)-naphthalen-4-yl-methanone和禽流感HA蛋白有最高的親合力，最有可能成為治療新型流感藥物的先導化合物。
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