?用動態時間扭曲及最小二乘平差比對蛋白質結構

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Title:	?用動態時間扭曲及最小二乘平差比對蛋白質結構 Dynamic Time Warping and Least Squares Adjustment for Protein tructure Alignment
Authors:	蕭雯鴻
Contributors:	生物資訊學系碩士班
Date:	2006
Issue Date:	2009-10-12 10:34:55 (UTC+0)
Publisher:	亞洲大學
Abstract:	在蛋白質的研究之中，蛋白質結構比對是很重要的一個部份。一般來說，蛋白質結構比對可以為兩個部份：整體比對與局部比對。在本研究之中，從原始的蛋白質結構之中取出了一維的特徵。其次混合了動態時間扭曲與最小二乘平差法做為整體蛋白質比對的基本步驟，並透過迭代的方式來求得比對結果。其中動態時間扭曲目的為找出蛋白質氨基酸的對應關係，動態時間扭曲則用以轉換座標並修正座標。利用比對中每一對應的氨基酸配對，計算出一權值來加速從粗略到精細比對的收斂。在結果之中，初步證實了對於整體比對的情況，本研究所使用的方法是有用且有效率的。然而，此方法對於比對的準確度及有效的使用計算機的記憶體仍有改善的空間。
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