人、小鼠與大鼠選擇性裁?事件的比較分析

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Title:	人、小鼠與大鼠選擇性裁?事件的比較分析 Comparative analysis of alternative splicing events in the human mouse and rat
Authors:	陳昭蓉
Contributors:	生物資訊學系碩士在職專班
Date:	2006
Issue Date:	2009-10-12 10:34:51 (UTC+0)
Publisher:	亞洲大學
Abstract:	選擇性裁切（alternative splicing）是很重要的後轉譯作用，並擔任參與蛋白質多樣性的必要角色。我們的研究使用跨物種的方法，藉由分析表現序列標籤，從15631對人與小鼠、13306對人與大鼠和15549對小鼠與大鼠的同源基因對中偵測與分析出選擇性裁切的保留與未保留事件。研究結果顯示人類與囓齒類動物的同源基因有很強的選擇性裁切關聯，並有相似的調控模式。在317個三物種共同保留的選擇性裁切事件中，exon-skipping事件有133個；選擇性裁切保留事件的表現多為主要表現形式，但仍有少部分展現較強的物種專一形式；而大多數的選擇性裁切保留事件發生在蛋白質的編碼區而非未轉譯區。此外，大部分的選擇性裁切事件並未在另一物種保留，此未保留事件也多以主要表現形式存在。研究中我們結合基因本體論(Gene Ontology)分類法發現，囓齒類動物特有的選擇性裁切保留事件多分布在分子的結合功能、參與細胞與生理的生物過程以及細胞與胞器的組成，而調控生物過程的保留度較低。最後，我們分別確定出64與555個組織專一，18與420個腫瘤專一及11與76個腫瘤組織專一的exon-skipping保留與未保留事件，此數據顯示選擇性裁切未保留事件與組織及腫瘤有很強的專一性。
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