利用基因組富集分析方法分析基因微陣列資料─以十字花科黑腐病菌感染阿拉伯芥為模型

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Title:	利用基因組富集分析方法分析基因微陣列資料─以十字花科黑腐病菌感染阿拉伯芥為模型
Authors:	陳靜怡
Contributors:	亞洲大學生物與醫學資訊學系碩士在職專班吳家樂
Keywords:	阿拉伯芥;十字花科黑腐病菌;基因微陣列;差異性表達基因;基因組富集分析
Date:	2012
Issue Date:	2012-11-14 11:07:28 (UTC+0)
Abstract:	研究植物對於生物性或非生物性環境壓力的反應機制，對於人類的疾病及藥物相關研究提供了解決問題的模型。同時，了解植物如何防禦環境壓力對於全世界糧食及農業生產有著重大意義。本研究以R語言及Bioconductor套件為主要操作介面，配合載入ArrayExpress資料庫及KEGG資料庫，綜合運用篩選差異性表達基因及基因組富集分析處理數據，最後進行文獻探討以驗證並整合結果，做出結論。主要結果說明了SGT1及HSP90複合體能夠透過泛素-蛋白?體系統中的SKp1調節或監控抗性蛋白RPM1引發過敏反應。本研究另提供十字花科黑腐病菌在不同實驗條件下，與農桿菌感染阿拉伯芥差異性表達基因的結果，以網頁呈現提供查詢，，網址為：http://ppi.bioinfo.asia.edu.tw/R_At_xcc/index.htm。
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