分析選擇性剪接造成肝癌蛋白功能域變化影響之蛋白質與蛋白質交互作用

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Title:	分析選擇性剪接造成肝癌蛋白功能域變化影響之蛋白質與蛋白質交互作用
Authors:	王傑瑋
Contributors:	Department of Bioinformatics
Keywords:	選擇性剪接;蛋白質域與蛋白質域交互作用;蛋白質與蛋白質交互作用;肝癌
Date:	2011
Issue Date:	2011-04-06 07:01:01 (UTC+0)
Publisher:	Asia University
Abstract:	大多數真核生物基因的蛋白質編碼區包含了外顯子（exon）和內含子（intron），某些編碼區中的內含子經過剪接後才能產生訊息RNA（mRNA）並能轉譯正確的蛋白質。而選擇性剪接（alternative splicing）可以連結蛋白質編碼區中不同的外顯子，形成不同的訊息RNA異構物（isoforms）。因此，當選擇性剪接發生時，訊息RNA的一部分可能會被剔除，使其所形成的蛋白質缺少某部分的蛋白質域（domain），從而改變蛋白質三維結構結構並破壞蛋白質交互作用和基因調控。本研究將以肝癌為特定對象，藉由肝癌相關蛋白質異構物結構上的差異所造成的蛋白質域與蛋白質域交互作用分析這些結構上有差異的蛋白質異構物的蛋白質與蛋白質交互作用。一些有關基因表達的生物資訊資料庫，GO和PubMed提供了DDI的詳細注解，並且引入具有統計意義的DDI排名與上述的注解結合成索引。某些肝癌相關蛋白質異構物，如TP53，已經發現有不同的PPI。因此，我們建立了一個透過DDI去預測可能的PPI的網站平台，該網站提供了一種簡單的方法來研究選擇性剪接在癌症中的作用。網址： http://ppi.bioinfo.asia.edu.tw/hccas/search
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